小智一行人在森林中迷了路，它们突然发现一只落单的走路草。
小智想要收服它，但被小霞抢先，小霞使用宝石海星顺利击倒走路草，正要收服它时，一只妙蛙种子冲出来救走了走路草。
小智看到自己梦寐以求想要得到的妙蛙种子十分兴奋，派巴大蝶与它对战，但却不是妙蛙种子的对手。
因为过河时吊桥突然崩塌，小刚掉进了湍急的河流，和另外两人走散。
在寻找小刚时，小智和小霞又因为踩中了一个机关而被吊在了树上。后来被小刚救下。
在波克比是谁的呢?中，小智一行人在旅途中来到某座城市的宝可梦中心。
吃饭的时候，小智一行人谈论起了在大傻谷得到的宝可梦的蛋，一旁火箭队偷听到这个消息，然后趁机抢走了这枚蛋。
小智一行人在找到火箭队时，喵喵正在照顾着蛋。在双方争夺蛋的时候，蛋孵化了，原来这是波克比的蛋。
之后为了争夺波克比，小智、小霞、小刚、喵喵进行了比赛。
但波克比把出生时第一眼看到的人当做父母，因此波克比把小霞当成了它的母亲，所以小霞获得波克比。
直到在超世代的出现，小霞的怀里基本上都一直抱着波克比。
在激斗!!宝可梦娃娃节中，小智一行人与火箭队都来到了娃娃镇。
恰逢娃娃节，小霞和武藏开始了大抢购。在商场，她们听说了有娃娃节娃娃女王比赛，获胜者将得到一整套娃娃。
就是冲着娃娃，小霞和武藏在同伴们的支持下开始了赛程。
小刚把他的六尾和小智把他的皮卡丘和妙蛙种子借给了小霞，因此小霞参加娃娃节美女比赛获得冠军。
但由于娃娃无法携带着旅行，所以就寄回去华蓝道馆了。
在华蓝道馆!!水中的战斗中，小霞的墨海马似乎因为缺乏运动而身体不适，因此小霞决定顺路回一趟家。
到了华蓝市，小智一行人发现华蓝道馆要举办水中芭蕾，而主角由小霞来扮演。
小霞勉为其难接受了主角的工作。另外，火箭队准备在水中芭蕾表演时夺取水属性宝可梦。在火箭队抢夺宝可梦时，小智他们击败了火箭队，并且小霞的小海狮进化成了白海狮。
由于小霞的姐姐们的要求，小霞把她的宝石海星寄放在了华蓝道馆；而墨海马由于需要休养，也暂存在华蓝道馆中。
在再见可达鸭，又来了哥达鸭！中，在哈撒岛，小智一行人遇到了另一位水属性宝可梦训练家小椿，她救起了小霞落水的可达鸭，她告诉小霞可达鸭有进化的征兆。
小霞和小椿进行宝可梦对决，对战中小霞发现自己的可达鸭似乎进化为哥达鸭了，这时小霞误以为自己的可达鸭已进化，并使用野生的哥达鸭击败了火箭队三人组和小椿。
但后来她发现可达鸭并没有进化，它一直待在球里，那只哥达鸭只不过是一只喜欢女孩子的野生宝可梦。
在蚊香蝌蚪和小霞！中，小智和小建在无名岛吸入了霸王花的麻痹粉，高烧不止。
小霞通过图鉴知道要寻找阿西蕾水草来治疗他们，因此小霞便去寻找蚊香蝌蚪。
与此同时，武藏也因为吸入霸王花的麻痹粉而让小次郎和喵喵出去找阿西蕾水草。
在池塘边，一只野生的蚊香蝌蚪跳了出来帮助小霞，而同样目标的小次郎和喵喵也发现了蚊香蝌蚪。
这时，敌对的双方在池塘边碰面了，双方为了蚊香蝌蚪大打出手，尔后在小霞获得阿西蕾水草时又出来进行抢夺。
虽然打赢了小次郎和喵喵，但小霞也知道他们也是为了拯救同伴，于是小霞把自己采到的阿西蕾水草分给了火箭队一部分，之后便给小智和小建喂阿西蕾水草吃。
小智一行人痊愈后，蚊香蝌蚪因为很喜欢小霞，想与小霞一起旅行，因此小霞收服了蚊香蝌蚪。
在小锯鳄是谁的？小智对抗小霞中，某日，小智一行人在钓鱼时，一只突然出现的小锯鳄引起了小霞和小智的注意。
两人同时使用诱饵球扔向小锯鳄，虽然抓住了小锯鳄但是却不知道是谁的精灵球抓住了小锯鳄。
为了公平地决出小锯鳄的归属权，小智和小霞决定通过三局两胜的决斗，赢的人得到小锯鳄。
首战小智派出了皮卡丘，而小霞派出了波克比，由于皮卡丘完全无法下手，丧失战斗意志，首战小霞获胜。
第二战小智派出了菊草叶对抗小霞派出的海星星，此战小智获胜。
最后一战小智派出了妙蛙种子对抗小霞派出的蚊香蝌蚪，在对战中，小智获得了胜利，三局两胜下赢得了小锯鳄，但是小霞的蚊香蝌蚪进化为了蚊香君。
在金鱼王钓鱼战斗中，小智一行人来到了钓金鱼王大赛，小智和小霞都报名参加了。
小霞遇到了一位使用蚊香泳士的训练家时夫，他的蚊香泳士欺负了小霞的蚊香君，还嘲笑小霞的宝可梦弱小。
小霞咽不下这口气，决定要在钓鱼大赛中击败时夫。火箭队也准备正式参赛。
大赛中，小霞与时夫钓上来的鱼同样重量，于是根据大赛规则以对战决定大赛第一名。
面对时夫的蚊香斗士，小霞再次用蚊香君对阵。
虽然前期被压制住了，但小霞与蚊香君面对时夫和他的蚊香斗士想要报仇的心情使得蚊香君重整旗鼓并打倒了蚊香斗士，也使得小霞成为大赛的第一名。
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