明龖和小遥以及小胜实在同一艘船上，离别谈不上什么“眼泪”，新的征程就在脚下，其实明龖和他们的情感始终不是同龄人的那种；小刚和小智也很快到了分手的岔路口，但火箭队三人组没有抛弃小智，应该说是皮卡丘，不过他们也对这个目前有点信心不足。
就在回到真新镇之前，尾随小智和皮卡丘的火箭队突然跟丢了目标，但“幸运”地发现了一个从没见过的电系宝可梦—电击魔兽，这种宝可梦他们肯定不会放过；奈何这是超级无敌“臭屁”小茂君的神奇宝贝，火箭队今天也就先飞一下了。作为宿敌，小智肯定要和小茂挑战一番，岂料后者以电击魔兽消耗了体力为由无情的拒绝了小智的请求。
电击魔兽是电属性的雷电宝可梦，是电击怪的最终进化形态，需要电击兽携带电力增幅器才能进化，这是一种积蓄着庞大电气力量的箱子，电系宝可梦都很喜欢它。比起电击兽，电击魔兽体型更大，有着粗壮的手臂，其背部也有两条类似雷管之类的东西；它的民间常见译名是狂电，其背部有看似双线插座的图案。储存满电后，两只角之间就会激烈地迸发出蓝白色的火花，会全然不顾对手的攻击接近对手，用两根尾巴的尖端按住对手，并放出超过２万伏特的电来进行攻击，没有发现超级进化石，能力还行出场率一般的存在。
小智回到真新镇，在自己家没有找到妈妈花子，马上很懂事的就去了大木博士的研究所，不过已开始也没有找到大家；原来大家还是为小智准备了欢迎回家的小惊喜，智爷也是志得意满的展示了自己完成对战开拓区挑战的证明，不过再次对上小茂有些事情必须继续。
在得知小茂的电击魔兽已经恢复了体力的消息之后，皮卡丘与它进行了战斗，一开始双方都是使用十万伏特和铁尾不分上下；小智想用皮卡丘的十万伏特引它跳上高空使用伏特攻击，结果被电击魔兽的反射壁弹飞，最终它使用了雷电拳战胜了皮卡丘。而之前当小智使用图鉴时，却得出无法辨认的宝可梦，对此大木博士也很快就帮小智更新了宝可梦图鉴；但由于小茂的一再刺激（这个混蛋已经早早的赶回来神奥地区），小智也决定第二天就出发前往神奥地区，智爷的最大目标应该不少宝可梦大师，而是那个人—小茂君。
小智第二天还是和自己的所有宝可梦一一告别，当然皮卡丘除外，神奥地区我们的智爷已经有点迫不及待了；不过他的长尾怪手也偷偷的离开了大木研究所，默默跟上小智乘坐的轮船，对此无能为力的小智也是欣然接受了命运的安排，一起跟着的还有从来都是“不离不弃”的火箭队三人组，显然这次他们也是躲在了“船底”，不应该看到对方有多甜蜜。
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